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Gene co-expression network analysis in zebrafish reveals chemical class specific modules.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8438978
BMC Genomics; Shankar P, McClure RS et. al.

Sep 15th, 2021 - Zebrafish is a popular animal model used for high-throughput screening of chemical hazards, however, investigations of transcriptomic mechanisms of toxicity are still needed. Here, our goal was to identify genes and biological pathways that Aryl Hydrocarbon Receptor 2 (AHR2) Activators and flame retardant chemicals (FRCs) alter in developing zebrafish. Taking advantage of a compendium of phenot...

Bufalin suppresses tumour microenvironment-mediated angiogenesis by inhibiting the STAT...
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8424978
Journal of Translational Medicine; Fang K, Zhan Y et. al.

Sep 10th, 2021 - Antiangiogenic therapy has increasingly become an important strategy for the treatment of colorectal cancer. Recent studies have shown that the tumour microenvironment (TME) promotes tumour angiogenesis. Bufalin is an active antitumour compound whose efficacy has been indicated by previous studies. However, there are very few studies on the antiangiogenic effects of bufalin. Herein, human umbil...

Machine Learning augmented docking studies of aminothioureas at the SARS-CoV-2-ACE2 int...
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8428716
PloS One; Rola M, Krassowski J et. al.

Sep 10th, 2021 - The current pandemic outbreak clearly indicated the urgent need for tools allowing fast predictions of bioactivity of a large number of compounds, either available or at least synthesizable. In the computational chemistry toolbox, several such tools are available, with the main ones being docking and structure-activity relationship modeling either by classical linear QSAR or Machine Learning te...

Cells of the human intestinal tract mapped across space and time.
https://doi.org/10.1038/s41586-021-03852-1 10.1016/j.devcel.2020.11.010 10.1016/j.stem.2020.11.008 10.1016/j.cell.2020.12.016 10.1038/s41590-020-0602-z 10.1016/j.cell.2018.08.067 10.1016/j.cell.2019.06.029 10.1126/sciimmunol.abb4432 10.1038/s41591-020-1003-4 10.1016/j.cell.2019.10.027 10.1016/j.cell.2019.08.008 10.1371/journal.pone.0079693 10.1038/s41586-019-0992-y 10.1126/science.abc1669 10.1016/j.cell.2020.04.036 10.1152/ajpregu.00638.2003 10.2337/db18-0883 10.1016/j.cell.2018.12.029 10.1210/endrev/bnaa018 10.1111/sji.12305 10.1038/s41593-020-00736-x 10.1053/j.gastro.2020.09.032 10.1053/j.gastro.2017.10.005 10.1053/j.gastro.2018.09.012 10.1038/s41598-017-14835-6 10.1016/j.ydbio.2016.06.042 10.1016/j.smim.2008.02.003 10.1038/s41590-020-0635-3 10.1038/s41586-019-1652-y 10.1016/j.immuni.2019.06.027 10.1016/j.immuni.2018.04.006 10.4049/jimmunol.1501162 10.1111/j.1365-2036.2011.04605.x 10.1038/ng.3760 10.1136/gutjnl-2012-303956 10.1007/s10875-020-00794-7 10.1293/tox.2016-0075 10.1038/s41590-018-0294-9 10.1016/j.immuni.2018.12.010 10.1038/ni.1668 10.1016/j.celrep.2017.01.063 10.1016/j.immuni.2013.11.006 10.4049/jimmunol.1501191 10.1016/j.immuni.2016.09.001 10.1038/s41590-019-0505-z 10.1126/science.1260419 10.1136/gutjnl-2017-314817 10.1093/gigascience/giaa151 10.1126/science.aad0501 10.1093/nar/gkaa1204 10.1126/science.1161431 10.1038/s41586-019-1154-y 10.1016/j.cell.2020.08.003 10.1016/j.cmet.2013.06.008 10.1016/j.scr.2016.04.011 10.1016/j.celrep.2017.05.019 10.1371/journal.pone.0176031 10.1158/2326-6066.CIR-19-0796 10.1371/journal.pone.0025391 10.1084/jem.20050879 10.4049/jimmunol.1900592 10.1038/s41422-020-00445-x 10.1016/j.cell.2017.02.021 10.1523/JNEUROSCI.0361-11.2011 10.1038/s41419-019-1540-2 10.1016/j.immuni.2018.12.009 10.1126/science.aau0964 10.1126/science.aam7511 10.1038/nmeth.3800 10.1038/nmeth.3545 10.1093/nar/gkv007 10.1038/s41587-020-0591-3 10.1186/s13059-019-1663-x 10.1126/sciimmunol.abe6291 10.1093/nar/gkt382 10.1093/bioinformatics/btu138 10.1093/bioinformatics/btv359 10.1038/s41596-020-0292-x 10.1038/s41586-018-0698-6 10.1371/journal.pgen.1000214 10.1016/j.ajhg.2014.03.004 10.1086/519024 10.1038/s41588-018-0278-6
Nature Elmentaite R, Kumasaka N et. al.

Sep 10th, 2021 - The cellular landscape of the human intestinal tract is dynamic throughout life, developing in utero and changing in response to functional requirements and environmental exposures. Here, to comprehensively map cell lineages, we use single-cell RNA sequencing and antigen receptor analysis of almost half a million cells from up to 5 anatomical regions in the developing and up to 11 distinct anat...

Immunogenic amino acid motifs and linear epitopes of COVID-19 mRNA vaccines.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8428655
PloS One; Wisnewski AV, Redlich CA et. al.

Sep 10th, 2021 - Reverse vaccinology is an evolving approach for improving vaccine effectiveness and minimizing adverse responses by limiting immunizations to critical epitopes. Towards this goal, we sought to identify immunogenic amino acid motifs and linear epitopes of the SARS-CoV-2 spike protein that elicit IgG in COVID-19 mRNA vaccine recipients. Paired pre/post vaccination samples from N = 20 healthy adul...

Kids and COVID: why young immune systems are still on top.
https://doi.org/10.1038/d41586-021-02423-8 10.7189/jogh.11.05013 10.1172/jci.insight.148694 10.1126/scitranslmed.abd5487 10.1038/s41467-021-24938-4 10.1038/s41467-021-21414-x 10.1038/s41587-021-01037-9 10.1126/science.abd4570 10.1126/science.abd4585 10.1126/sciimmunol.abl4340 10.1038/s41467-021-22236-7
Nature Mallapaty S

Sep 9th, 2021 - Kids and COVID: why young immune systems are still on top.|2021|Mallapaty S,|epidemiology,genetics,immunology,virology,immunology,virology,genetics,immunology,genetics,immunology,metabolism,genetics,immunology,genetics,immunology,immunology,immunology,epidemiology,virology,immunology,

Extracellular Vesicles and Glycosylation.
https://doi.org/10.1007/978-3-030-70115-4_6 10.3389/fimmu.2014.00442 10.1016/S0304-4165(99)00165-8 10.1038/nn.4132 10.1074/jbc.M115.660878 10.1038/ncb2502 10.1021/pr200434y 10.1016/j.ccell.2016.10.009 10.1038/s41586-018-0392-8 10.1186/1757-2215-1-3 10.1242/jcs.128868 10.1016/j.cell.2014.01.043 10.1016/S0021-9258(18)33746-3 10.1080/20013078.2019.1648995 10.1101/glycobiology.3e.044 10.1101/glycobiology.3e.045 10.1152/ajplung.00151.2016 10.1038/ncomms4477 10.3390/biom5031741 10.1038/73163 10.1083/jcb.97.2.329 10.1038/nature15756 10.1038/s41467-018-04313-6 10.1016/j.cell.2019.02.029 10.1523/JNEUROSCI.3137-12.2013 10.1371/journal.pone.0027084 10.1042/BJ20150607 10.1073/pnas.1521230113 10.1038/nchembio.151 10.1016/j.ccell.2018.01.009 10.1074/jbc.M114.606269 10.1038/s41556-018-0250-9 10.1038/nature14581 10.3389/fimmu.2014.00383 10.1016/j.cub.2009.09.059 10.1073/pnas.1200448109 10.1080/20013078.2020.1713527 10.1016/j.cell.2006.08.019 10.1016/j.cell.2005.09.041 10.1038/nm.2414 10.1097/WNR.0b013e32832e4b9d 10.1016/0092-8674(83)90040-5 10.1038/nm.2753 10.1038/nrc3982 10.1016/j.cell.2019.02.016 10.1084/jem.183.3.1161 10.1038/nri3622 10.1038/s41556-019-0404-4 10.1038/cr.2015.29 10.1038/s41598-018-22450-2 10.1158/0008-5472.CAN-04-3117 10.1038/s41467-018-02865-1 10.1016/j.bbrc.2017.07.126 10.1038/s41598-019-47760-x 10.1016/j.cell.2019.04.017 10.1152/physiol.00045.2018 10.1074/jbc.M115.638759 10.1021/bi200218s 10.1038/ncomms15287 10.1016/bs.acr.2014.11.001 10.1038/ni854 10.1080/20013078.2018.1535750 10.1126/science.1153124 10.1016/j.devcel.2011.08.019 10.1080/20013078.2018.1442985 10.1038/s41598-019-48499-1 10.1074/jbc.M800836200 10.1016/j.ab.2019.06.001 10.1073/pnas.92.19.8754 10.1038/s41556-018-0040-4 10.1016/j.celrep.2019.01.009 10.1016/s0925-4439(01)00044-8
Advances in Experimental Medicine and Biology; Harada Y, Ohkawa Y et. al.

Sep 9th, 2021 - Extracellular vesicles (EVs), a generic term for any vesicles or particles that are released from cells, play an important role in modulating numerous biological and pathological events, including development, differentiation, aging, thrombus formation, immune responses, neurodegenerative diseases, and tumor progression. During the biogenesis of EVs, they encapsulate biologically active macromo...

The Importance of Glycosylation in COVID-19 Infection.
https://doi.org/10.1007/978-3-030-70115-4_12 10.1016/0042-6822(90)90257-R 10.1172/JCI65708 10.1016/j.bbamcr.2013.04.001 10.1073/pnas.0808248105 10.1128/mBio.00204-19 10.1038/s41591-020-0820-9 10.1016/j.jim.2012.05.022 10.1097/00002030-199104000-00014 10.1146/annurev.immunol.25.022106.141702 10.1038/s41586-020-2538-8 10.1016/j.cell.2016.10.042 10.3389/fpubh.2020.567184 10.1093/glycob/cwy021 10.1021/pr300887z 10.1002/art.23865 10.1681/ASN.2015010109 10.1126/science.abd4585 10.1128/JVI.01894-16 10.1073/pnas.0809524106 10.1038/s41467-017-01525-0 10.1093/glycob/cwr182 10.1016/j.cell.2020.04.026 10.1126/science.8018146 10.1006/viro.1996.0165 10.1128/JVI.01906-07 10.1002/jmv.25887 10.4049/jimmunol.1700116 10.1038/s41577-020-0308-3 10.1038/s41467-017-02088-w 10.1038/s41421-020-0147-1 10.1021/acscentsci.0c01056 10.1086/518892 10.1038/s41423-019-0306-1 10.1128/CMR.00023-07 10.1038/s41587-020-0602-4 10.3389/fmicb.2020.01704 10.1111/hae.13013 10.1371/journal.ppat.1003831 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Advances in Experimental Medicine and Biology; Petrović T, Lauc G et. al.

Sep 9th, 2021 - Coronavirus disease 2019 (COVID-19), caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), is currently one of the major health problems worldwide. SARS-CoV-2 survival and virulence are shown to be impacted by glycans, covalently attached to proteins in a process of glycosylation, making glycans an area of interest in SARS-CoV-2 biology and COVID-19 infection. The SARS-CoV-2 u...

Protein Glycosylation in Diabetes.
https://doi.org/10.1007/978-3-030-70115-4_14 10.1007/s40200-018-0365-3 10.1016/j.bbamcr.2013.04.001 10.2337/diacare.27.7.1798 10.1900/RDS.2015.12.330 10.1515/jpem-2014-0384 10.1016/s1471-4906(01)01890-7 10.2337/dc17-1042 10.1038/414813a 10.1074/jbc.272.43.27353 10.1038/nrneph.2016.191 10.1016/s0002-9378(99)70662-9 10.1161/01.RES.0000194323.77203.fe 10.1074/jbc.M115.674671 10.1016/j.diabres.2018.02.023 10.1371/journal.pmed.1002488 10.1016/0896-8411(91)90021-4 10.1038/nrdp.2015.19 10.1038/35055582 10.1016/j.cell.2009.12.008 10.2337/diaspect.27.1.9 10.1016/S0140-6736(18)31320-5 10.1016/j.bbagen.2018.08.005 10.1007/s00125-013-2962-5 10.2337/db07-1331 10.1093/molbev/msp108 10.1038/ng.2794 10.1038/nrendo.2016.50 10.1016/j.mpmed.2014.09.007 10.2337/diaclin.29.3.116 10.1016/0143-4004(77)90011-x 10.1074/jbc.M701890200 10.1074/jbc.M111.253955 10.1093/hmg/ddl147 10.4103/2230-8210.102989 10.1126/science.7678183 10.1006/bbrc.1996.0015 10.2337/dc09-9033 10.2337/dc18-0422 10.1074/jbc.M116.747667 10.1007/s00125-017-4426-9 10.1007/s11892-015-0681-7 10.1016/j.cmet.2011.01.018 10.1016/j.cell.2007.01.049 10.1371/journal.pgen.1001256 10.2337/db10-1186 10.1016/j.bbagen.2017.06.020 10.1089/omi.2019.0075 10.1016/j.healthplace.2009.12.015 10.1089/omi.2019.0052 10.1038/nature14177 10.1111/pedi.12151 10.1038/s41588-018-0241-6 10.1016/S0021-9258(19)67706-9 10.2337/db05-1672 10.1016/s1056-8727(01)00188-x 10.1016/S0083-6729(08)00615-8 10.1038/s41572-019-0098-8 10.1016/S1074-7613(01)00244-8 10.1097/MED.0b013e328355b7fe 10.1016/j.mam.2012.07.001 10.18632/oncotarget.8155 10.1038/nrm2327 10.1007/BF02427280 10.1093/hmg/5.7.1075 10.1016/j.cell.2005.09.041 10.1038/nm.2414 10.1016/j.bbrc.2013.03.076 10.1038/ng.3245 10.1074/mcp.M115.054221 10.1016/S0140-6736(09)60568-7 10.11613/BM.2018.020703 10.1023/A:1012412908983 10.1159/000207484 10.3803/EnM.2018.33.2.147 10.1007/s11892-014-0508-y 10.1038/s41581-019-0129-4 10.2337/diacare.25.6.951 10.1016/j.cell.2013.12.012 10.1016/j.ab.2007.12.012 10.1002/1873-3468.13495 10.1007/s00125-010-1799-4 10.1038/nature14132 10.1136/bmjdrc-2019-001026 10.3945/jn.113.180695 10.2337/db11-0638 10.1007/s40142-014-0039-5 10.1172/JCI89333 10.2337/db12-0880 10.2337/dc20-S002 10.1016/S0021-9258(18)99202-1 10.1210/rp.56.1.1 10.1542/peds.2012-1132 10.3389/fimmu.2018.00277 10.1371/journal.pone.0032675 10.1038/nm.2353 10.2337/dc19-1507 10.1038/s12276-018-0157-3 10.1002/eji.201242374 10.1016/s0026-0495(98)90058-0 10.1042/BJ20120232 10.1007/s11892-015-0699-x 10.1001/jama.2013.6285
Advances in Experimental Medicine and Biology; Štambuk T, Gornik O

Sep 9th, 2021 - Diabetes mellitus is a group of metabolic disorders characterized by the presence of hyperglycaemia. Due to its high prevalence and substantial heterogeneity, many studies have been investigating markers that could identify predisposition for the disease development, differentiate between the various subtypes, establish early diagnosis, predict complications or represent novel therapeutic targe...

Redox proteomic study of Bacillus cereus thiol proteome during fermentative anaerobic g...
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8425097
BMC Genomics; Hamitouche F, Gaillard JC et. al.

Sep 9th, 2021 - Bacillus cereus is a notorious foodborne pathogen, which can grow under anoxic conditions. Anoxic growth is supported by endogenous redox metabolism, for which the thiol redox proteome serves as an interface. Here, we studied the cysteine (Cys) proteome dynamics of B. cereus ATCC 14579 cells grown under fermentative anoxic conditions. We used a quantitative thiol trapping method combined with p...

Mucin-Type O-GalNAc Glycosylation in Health and Disease.
https://doi.org/10.1007/978-3-030-70115-4_2 10.1186/1471-2407-11-339 10.1007/BF01521345 10.1073/pnas.0607872103 10.1016/S0016-5085(98)70529-3 10.1084/jem.20061929 10.1021/pr0500814 10.1128/JVI.01166-10 10.1016/j.jmb.2016.02.010 10.1074/jbc.M109.065169 10.1074/jbc.M111.312587 10.1093/glycob/cwy021 10.1074/jbc.M116.721746 10.1002/1873-3468.13177 10.15252/embr.201948885 10.1186/s12885-018-5074-2 10.1080/00313020126324 10.1371/journal.pone.0125994 10.1016/S0014-5793(99)01268-5 10.1074/jbc.274.36.25362 10.1093/glycob/cwr182 10.1016/S0925-4439(99)00069-1 10.1053/j.gastro.2016.03.039 10.1038/mi.2016.45 10.1146/annurev.med.051308.111339 10.1016/0014-5793(91)81257-9 10.1160/TH12-08-0549 10.1172/JCI77139 10.4049/jimmunol.1200392 10.1038/nature12723 10.1093/glycob/8.1.87 10.1038/sj.embor.7400705 10.1093/glycob/11.5.385 10.1023/A:1022240107040 10.18632/oncotarget.22168 10.1016/j.bbrc.2005.12.216 10.1093/annonc/mdm007 10.1016/j.bbadis.2008.10.008 10.1158/0008-5472.CAN-10-1303 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Advances in Experimental Medicine and Biology; Bagdonaite I, Pallesen EMH et. al.

Sep 9th, 2021 - Mucin-type GalNAc O-glycosylation is one of the most abundant and unique post-translational modifications. The combination of proteome-wide mapping of GalNAc O-glycosylation sites and genetic studies with knockout animals and genome-wide analyses in humans have been instrumental in our understanding of GalNAc O-glycosylation. Combined, such studies have revealed well-defined functions of O-glyc...

N-Glycosylation.
https://doi.org/10.1007/978-3-030-70115-4_1 10.1093/glycob/6.4.439 10.1016/j.ccell.2017.05.007 10.1042/bj2780721 10.1097/PAI.0b013e3181e3bf0d 10.1038/14020 10.1074/jbc.M313245200 10.1016/j.cell.2016.05.048 10.1111/j.1432-1033.1993.tb18274.x 10.1111/j.1432-1033.1989.tb21096.x 10.1074/jbc.M506358200 10.1038/s41586-020-2044-z 10.1126/science.aac7557 10.1091/mbc.E09-05-0398 10.1126/science.aar7899 10.1016/0300-9084(88)90289-1 10.1074/jbc.272.31.19575 10.1093/glycob/8.5.455 10.1093/glycob/9.6.617 10.1016/S0021-9258(18)53309-3 10.1016/j.febslet.2015.07.021 10.1016/j.cell.2010.10.028 10.1038/onc.2015.225 10.1016/j.bbagen.2011.06.016 10.1038/s41589-019-0288-4 10.1073/pnas.1220425110 10.18632/oncotarget.11284 10.1016/j.ceb.2016.03.021 10.1038/srep20946 10.1083/jcb.201404083 10.1074/jbc.M010896200 10.1016/j.bbagen.2006.06.011 10.1016/j.ymgme.2011.12.012 10.1016/S0021-9258(17)43670-2 10.1073/pnas.76.9.4235 10.1074/jbc.M202369200 10.1016/j.cell.2018.10.037 10.1093/glycob/8.1.77 10.1038/gim.2014.22 10.1093/glycob/cwj002 10.1371/journal.pgen.1006696 10.1053/j.gastro.2016.03.002 10.1074/jbc.M110.172536 10.1074/jbc.M111.315333 10.1074/jbc.M804060200 10.1093/glycob/cwh072 10.1074/jbc.M507569200 10.1038/s41467-020-14794-z 10.1074/jbc.274.30.21375 10.1038/73163 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a124091 10.1074/jbc.M109.060806 10.15252/embr.201643504 10.1111/j.1432-1033.1994.tb19996.x 10.1038/415447a 10.1016/S0021-9258(17)36963-6 10.1074/jbc.M512191200 10.1093/glycob/cwq001 10.1074/jbc.M303395200 10.1093/glycob/cwp104 10.1073/pnas.1414593112 10.1083/jcb.201004102 10.1093/glycob/cwl079 10.1016/j.bbagen.2020.129596 10.1074/jbc.M607771200 10.1091/mbc.7.3.483 10.1093/glycob/3.4.357 10.1074/jbc.RA120.013291 10.1074/jbc.M117.813030 10.1016/j.bbrc.2012.06.081 10.1074/jbc.M505757200 10.1074/jbc.271.43.26706 10.1016/0076-6879(94)30021-6 10.1016/s1097-2765(03)00243-0 10.15252/emmm.201404438 10.1042/BJ20150607 10.1126/sciadv.aax0301 10.1074/jbc.274.46.32778 10.1074/mcp.M115.048298 10.1073/pnas.87.24.9948 10.1038/gim.2016.75 10.1016/S0021-9258(19)84565-9 10.1016/j.bbagen.2015.10.016 10.1016/j.cell.2019.03.035 10.1016/j.bbagen.2008.03.005 10.1093/emboj/19.11.2475 10.1093/emboj/17.17.4920 10.1126/science.1205677 10.1093/glycob/cwi014 10.1002/(sici)1097-0215(19970917)72:6<1117::aid-ijc29>3.0.co;2-# 10.1038/nrm3383 10.1038/s41467-018-05931-w 10.1074/mcp.RA119.001534 10.1073/pnas.76.9.4322 10.1136/jmedgenet-2012-100819 10.1038/ncb1298 10.1016/j.ajhg.2017.12.009 10.1083/jcb.201404075 10.1016/S0021-9258(19)37172-8 10.1093/glycob/cwp001 10.1021/bi060878o 10.1074/jbc.272.36.22721 10.1007/s10719-006-6216-3 10.1038/nm.2414 10.1016/j.cell.2006.08.019 10.1016/j.cell.2005.09.041 10.1016/j.bbrc.2006.08.186 10.1091/mbc.E11-02-0118 10.1126/science.1102109 10.1038/nrc3982 10.1016/j.molonc.2009.12.001 10.1172/JCI5826 10.1126/science.aaz3505 10.1074/jbc.M407474200 10.1093/glycob/6.5.493 10.1111/j.1600-0854.2010.01078.x 10.1073/pnas.80.22.6750 10.1242/jcs.103952 10.1007/s00418-016-1513-9 10.1016/j.cell.2008.11.047 10.1074/jbc.M109.000893 10.1083/jcb.136.1.45 10.1074/jbc.274.19.13547 10.1074/jbc.M005860200 10.1093/glycob/cwq147 10.1021/bi800723n 10.1038/s41598-017-12283-w 10.1139/o86-026 10.1038/nature23314 10.1038/ncb1299 10.1042/bst0070322 10.1515/BC.2001.039 10.1074/jbc.M202069200 10.1074/jbc.M210665200 10.1016/S0021-9258(18)82268-2 10.3390/molecules20069816 10.1073/pnas.91.13.5977 10.1101/glycobiology.3e.009 10.1016/j.tibs.2011.06.001 10.1186/s12014-019-9254-0 10.1016/j.mam.2016.05.004 10.1042/BJ20060945 10.1083/jcb.149.5.1039 10.1073/pnas.152333599 10.1074/jbc.M004673200 10.1093/glycob/cwp200 10.1093/glycob/10.4.403 10.1038/nm1305 10.1021/acscentsci.7b00224 10.1016/S0021-9258(18)83136-2 10.1016/S0021-9258(18)83137-4 10.1093/glycob/8.6.585 10.1074/jbc.M004935200 10.1093/glycob/10.5.493 10.1016/S0021-9258(18)34274-1 10.1016/S0021-9258(18)34831-2 10.1074/jbc.271.44.27810 10.1016/j.molcel.2017.10.028 10.1007/s00418-008-0384-0 10.1093/glycob/cww086 10.1093/glycob/cwv091 10.15252/embj.201488375 10.1093/glycob/cwu051 10.1074/jbc.M510893200 10.1073/pnas.0507375102 10.1016/s0006-291x(76)80218-5 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021631 10.1038/s41594-018-0031-y 10.1023/a:1006951519522 10.1074/jbc.271.23.13811 10.1073/pnas.92.19.8754 10.1016/j.febslet.2012.04.057 10.14670/HH-24.1193 10.1111/j.1349-7006.2008.00839.x
Advances in Experimental Medicine and Biology; Hirata T, Kizuka Y

Sep 9th, 2021 - N-glycosylation is a highly conserved glycan modification, and more than 7000 proteins are N-glycosylated in humans. N-glycosylation has many biological functions such as protein folding, trafficking, and signal transduction. Thus, glycan modification to proteins is profoundly involved in numerous physiological and pathological processes. The N-glycan precursor is biosynthesized in the endoplas...

Other Types of Glycosylation.
https://doi.org/10.1007/978-3-030-70115-4_5 10.1016/j.cell.2007.12.016 10.1074/jbc.RA119.012280 10.1016/j.biopha.2014.07.005 10.1002/ajmg.a.61362 10.1080/15592294.2017.1334023 10.1016/j.ajhg.2013.12.003 10.1016/j.ydbio.2016.05.038 10.1016/j.nmd.2013.12.011 10.1016/j.stem.2008.08.001 10.1038/35019075 10.1038/jid.2014.406 10.1002/jcp.26858 10.1038/emboj.2012.143 10.1111/cpr.12037 10.1093/biolre/ioz110 10.1111/cpr.12745 10.1016/j.bbrc.2016.12.172 10.1016/j.ydbio.2010.07.008 10.1038/srep33974 10.1002/cmdc.202000077 10.1186/s13052-016-0289-9 10.1089/omi.2017.0037 10.1242/dev.060020 10.1038/nature12605 10.1186/s12903-018-0559-6 10.1002/ajmg.a.36951 10.1186/s13039-018-0358-4 10.1371/journal.pgen.1004795 10.1080/07853890802301975 10.1038/nature05571 10.1038/s41598-018-36490-1 10.1016/j.sbi.2018.12.005 10.1093/hmg/ddz225 10.1210/jc.2017-01531 10.1074/jbc.M114.616847 10.1016/j.neulet.2020.135074 10.3892/ol.2014.2197 10.1242/dev.124.11.2245 10.1016/j.devcel.2016.12.013 10.1177/039463200902200325 10.1093/glycob/cws060 10.1016/j.mcn.2008.07.026 10.1016/j.jdcr.2020.02.016 10.1038/srep16449 10.1002/ijc.32627 10.1111/bjd.13702 10.2340/00015555-3119 10.1016/j.cell.2009.03.045 10.1371/journal.pgen.1003547 10.1007/s00432-018-2735-0 10.1146/annurev-biochem-060713-035344 10.1016/j.ajhg.2013.04.022 10.1111/jdv.13323 10.1038/s41467-017-00255-7 10.1093/hmg/ddy414 10.1038/cddis.2014.335 10.1016/j.biopha.2017.01.026 10.1126/science.1261093 10.1126/science.aaf9739 10.3892/or.2019.7368 10.1016/j.bbrc.2016.03.062 10.1093/glycob/cwg113 10.1074/jbc.M115.710483 10.1093/glycob/cwx020 10.1038/35019000 10.1631/jzus.B1900150 10.1074/jbc.M114.598821 10.1242/dev.022319 10.1016/j.mod.2008.04.007 10.3389/fendo.2018.00599 10.1038/s10038-018-0548-2 10.1111/bjd.16274 10.1016/j.jid.2018.10.030 10.1371/journal.pgen.1005551 10.2174/156652407780831593 10.1074/jbc.M111.268243 10.1007/s10719-020-09917-z 10.1016/j.bbrc.2012.01.098 10.1093/glycob/cwl035 10.1093/glycob/cwx034 10.15252/emmm.201505815 10.1074/jbc.C109.065409 10.1074/jbc.M111.302406 10.1016/j.ebiom.2018.11.008 10.1152/physrev.00005.2017 10.1134/S0026898419040141 10.1111/ced.12790 10.1002/mgg3.466 10.1073/pnas.1109696108 10.1074/jbc.M112.401315 10.1074/jbc.M117.800102 10.1073/pnas.1804005115 10.1093/glycob/cwy014 10.1073/pnas.1319683111 10.1002/hep.28024 10.1038/s41436-020-0840-3 10.1111/dgd.12643 10.1038/nchembio.2019 10.1016/j.cub.2014.11.049 10.1016/j.bbrc.2017.07.053 10.1074/jbc.M701065200 10.1089/gtmb.2009.0145 10.1038/s41467-017-00654-w 10.4081/hr.2018.7576 10.1111/bjd.14914 10.1016/j.ccr.2012.03.041 10.7717/peerj.8841 10.3892/ijo.2013.2110 10.1038/nchembio.1927 10.1038/s41419-019-1703-1 10.1038/s41419-019-2005-3 10.1080/15384101.2019.1578145
Advances in Experimental Medicine and Biology; Tsukamoto Y, Takeuchi H

Sep 9th, 2021 - O-Linked glycosylation such as O-fucose, O-glucose, and O-N-acetylglucosamine are considered to be unusual. As suggested by the high levels of evolutional conservation, these O-glycans are fundamentally important for life. In the last two decades, our understanding of the importance of these glycans has greatly advanced. In particular, identification of the glycosyltransferases responsible for ...

New insight into the mechanism of granulocyte colony-stimulating factor (G-CSF) that in...
https://doi.org/10.1080/16078454.2021.1965725
Hematology (Amsterdam, Netherlands); Theyab A, Algahtani M et. al.

Sep 9th, 2021 - Over the past 20 years, granulocyte colony-stimulating factor (G-CSF) has driven the attention of researchers as a therapeutic agent for curing patients suffering from neutropenia. Despite the successful use of G-CSF, it currently requires daily injections, which are inconvenient, expensive, and distressing for children. Therefore, an alternative strategy for using G-CSF for treatment is needed...

Variations and characteristics of the various clinical phenotypes in a cohort of Nigeri...
https://doi.org/10.1080/16078454.2021.1972242
Hematology (Amsterdam, Netherlands); Duru A, Madu AJ et. al.

Sep 9th, 2021 - Sickle cell anaemia affects about 4 million people across the globe, making it an inherited disorder of public health importance. Red cell lysis consequent upon haemoglobin crystallization and repeated sickling leads to anaemia and a baseline strain on haemopoiesis. Vaso-occlusion and haemolysis underlies majority of the chronic complications of sickle cell. We evaluated the clinical and labora...

Engineered SARS-CoV-2 receptor binding domain improves manufacturability in yeast and i...
https://doi.org/10.1073/pnas.2106845118
Proceedings of the National Academy of Sciences of the Un... Dalvie NC, Rodriguez-Aponte SA et. al.

Sep 9th, 2021 - Global containment of COVID-19 still requires accessible and affordable vaccines for low- and middle-income countries (LMICs). Recently approved vaccines provide needed interventions, albeit at prices that may limit their global access. Subunit vaccines based on recombinant proteins are suited for large-volume microbial manufacturing to yield billions of doses annually, minimizing their manufac...

Developmental genetics of color pattern establishment in cats.
https://doi.org/10.1038/s41467-021-25348-2 10.1098/rspb.2010.1734 10.1016/j.jtbi.2016.11.003 10.1098/rstb.1952.0012 10.1016/j.devcel.2010.06.006 10.1038/ng.1090 10.1371/journal.pbio.2002117 10.1016/j.jtbi.2005.10.016 10.1126/science.1085887 10.1146/annurev-genet-112618-043741 10.1016/j.cub.2014.11.013 10.1016/j.tig.2014.11.005 10.1002/(SICI)1521-1878(199808)20:8<603::AID-BIES1>3.0.CO;2-J 10.1126/science.1220893 10.1242/dev.121.10.3223 10.1534/genetics.109.109629 10.1101/gr.6380007 10.2460/javma.2003.222.42 10.1046/j.1439-0264.2002.00360.x 10.1007/BF02986074 10.1038/nbt.4314 10.1016/0092-8674(80)90094-X 10.1016/j.devcel.2015.06.023 10.1186/1471-2105-14-128 10.1016/j.devcel.2009.05.011 10.1016/S0925-4773(01)00452-X 10.1002/jez.1400250207 10.1146/annurev-animal-031412-103659 10.1093/oxfordjournals.jhered.a110438 10.1111/j.1365-2052.2006.01458.x 10.1186/s12864-016-2595-4 10.1074/jbc.RA118.002918 10.1002/1521-1878(200008)22:8<753::AID-BIES9>3.0.CO;2-Z 10.1111/j.1755-148X.2010.00723.x 10.1016/S0960-9822(03)00128-3 10.1074/jbc.M702650200 10.1126/sciadv.1700299 10.1093/bioinformatics/btt143 10.1038/ng.3036 10.4161/fly.19695 10.1093/bioinformatics/btp324 10.1038/ng.2892 10.1038/s41587-019-0036-z 10.1086/521987
Nature Communications; Kaelin CB, McGowan KA et. al.

Sep 9th, 2021 - Intricate color patterns are a defining aspect of morphological diversity in the Felidae. We applied morphological and single-cell gene expression analysis to fetal skin of domestic cats to identify when, where, and how, during fetal development, felid color patterns are established. Early in development, we identify stripe-like alterations in epidermal thickness preceded by a gene expression p...

Dioscin attenuates lipopolysaccharide-induced inflammatory myocardial injury through ox...
https://doi.org/10.21037/apm-21-1613
Annals of Palliative Medicine; Xu Z, Li X et. al.

Sep 8th, 2021 - Lipopolysaccharide (LPS) is one of the main causes of myocardial injury. Dioscin has a protective effect on myocardial injury induced by LPS; however, the biological function and mechanism remain unclear. The purpose of this study was to investigate the effect of dioscin on myocardial injury induced by LPS. The myocardial injury model was constructed through LPS treatment of primary rat cardiom...

Efficacy of omega-3 polyunsaturated fatty acids on hormones, oxidative stress, and infl...
https://doi.org/10.21037/apm-21-2018
Annals of Palliative Medicine; Yuan J, Wen X et. al.

Sep 8th, 2021 - There is a close relationship between hormones, oxidative stress, and inflammatory factors and polycystic ovary syndrome (PCOS). This meta-analysis was conducted to evaluate the changes in hormones, oxidative stress, and inflammatory factors of PCOS patients who were supplemented with omega-3 polyunsaturated fatty acids (n-3 PUFAs). The databases of PubMed, Cochrane Library, Embase, and Web of ...

Transient receptor potential ankyrin 1 mediates cisplatin-induced apoptosis in renal tu...
https://doi.org/10.21037/apm-21-1867
Annals of Palliative Medicine; Meng X, Zhang Y et. al.

Sep 8th, 2021 - Cisplatin has been a vital drug used for tumor treatment because of its excellent effect on numerous malignant solid cancers. Nonetheless, its nephrotoxicity is non-negligible in clinical practice. This study aims to provide a new understanding of the molecular mechanism of transient receptor potential ankyrin 1 (TRPA1) in cisplatin-induced renal apoptosis. We evaluated the effect on apoptosis,...